L'une des particularités des SCPI est qu'elles sont fiscalement transparentes. Chaque détenteur de part déclare à titre personnel les revenus perçus au titre de l'impôt sur le revenu s'il s'agit d'une personne physique, soit au titre de l'impôt sur les sociétés s'il s'agit d'une personne morale. Les SCPI n'entrent pas dans le champ d'application de l'impôt sur les sociétés.

Les personnes physiques détentrices de parts de SCPI, sont soumises aux dispositions suivantes :

1) Revenus fonciers
Chaque année, la société de gestion communique aux associés les montants à déclarer ainsi que les explications nécessaires pour remplir leur déclaration de revenus. Les déficits fonciers résultant des dépenses déductibles, peuvent être déduits du revenu global dans la limite d'un plafond de 10 700€ par an. Les intérêts d'emprunts contractés pour l'acquisition de parts de SCPI, sont déductibles des revenus fonciers.

2) Régime du micro foncier
Lorsque les revenus de parts de SCPI ne dépassent pas 15 000€, les détenteurs de parts peuvent bénéficier d'un abattement forfaitaire de 30%. Ces revenus s'ajoutent aux autres revenus fonciers qu'ils doivent percevoir sans toutefois bénéficier d'un régime fiscal dérogatoire ( Besson, Robien, Méhaignerie, Perissol ).

3) Revenus financiers
Les revenus financiers provenant de placement de trésorerie de la société de gestion sont imposé au niveau de chaque associé. Une option pour le prélèvement libératoire peut être prévu lors de la souscription au taux de 26%.

Lors de la revente des parts de SCPI, la plus value est égale à la différence entre la somme provenant du produit de la vente, et le prix d'acquisition des parts. Un abattement de 10% par année de détention au-delà de la cinquième année est prévu et vient s'ajouter à un abattement forfaitaire de 1000€. Le taux d'imposition est de 26% y compris prélèvements sociaux. Par le jeu des abattements, toute plus value sera exonérée au bout de 15 ans.

Les prélèvements forfaitaires constituent une charge globale de 10% se décomposant en 2% de prélèvement social, 7,5% de CSG (contribution sociale généralisée) et 0,5% de CRDS (contribution au remboursement de la dette sociale). Ils s'appliquent aux revenus financiers et ne sont pas prélevés par l'intermédiaire de la société de gestion sauf pour les associés ayant opté pour le prélèvement libératoire sur les revenus fonciers.